崇拜男性生殖器，这是性崇拜的主要内容之一。中国古代有许多岩画，其中很多都表现了男子硕大的阴茎。例如在新疆呼图壁、内蒙古的阴山和桌子山、广西的左右江、宁夏的贺兰山等地都有一些原始岩画，许多岩画内容都反映出原始初民的性崇拜状况。他们以柱状物来象征男性生殖器，朝它顶礼膜拜，并称之为“祖”，如陶祖、铜祖、玉祖、石祖、木祖等，这一“祖”字，就说明他们认为这是祖先，是生命的起源。据考证，“祖”字的左边旁“示”字是神之意，而右边旁“且”则是男根的象征物，这在甲骨文中的“且”字看得再逼真没有了。
性崇拜是人类性文化的初始状态，全世界的各个民族几乎概莫能外。生殖器崇拜是性崇拜的一个主要内容，日本古代这方面的表现也很突出。据北野博美查考，有这方面内容的神庙至今还有400座左右。许多神庙所供奉的神像，包括男神和女神，都露有生殖器，而这是神圣的和有力的象征。分布较广的男神有道祖神，以甲州、信州为最多，还有塞神，又名幸神、石神，以九州较多；还有金精神，以奥州最多；又有道镜神，以九州、奥州最多。人们尊崇这些神像，也尊崇他们的生殖器，常去抚摸、亲吻，以求爱情和婚姻幸福，或祈求得子。据当地民众介绍，这种风俗是从中国传过来的。
日本古代还十分崇尚外形类似男女生殖器的石头，认为它们是神灵，于是朝它们顶礼膜拜。日本人崇尚自然，他们对大自然的崇拜，例如山崇拜、水崇拜、石崇拜、火崇拜等，比古代中国人有过之而无不及。他们将这些类似男女生殖器的石头称为“阴阳石”或“凹凸石”，直至今日，“阴阳石”或“凹凸石”还遍布日本的许多地区，人们还把它们看成是一种奇景，一种圣物。特别是日本的女阴崇拜多以天然的洞窟或凹形的自然石为其象征，最有名的是土佐长冈郡介良村朝峰神社背后的洞窟，深五丈余，形似女性生殖器，许多妇女都去祈求怀胎、安产。
在中国也是同样。四川盐原的公母山、江西龙虎山的金枪峰和羞女岩、广东丹霞山的阴元石和阳元石等等，千百年来都受人供奉、膜拜。
在世界上的许多民族中，女阴崇拜和男根崇拜一样地盛行，甚至有过之而无不及。这和母亲崇拜有很大关系。这是因为，在漫长的群婚杂交的时期，民知其母而不知其父，甚至不知道男人的阴茎和生殖有什么关系，而只知道人是从女人的阴户中出来的，所以崇拜女阴，歌颂女阴。千百年来，基督教的教堂遍布世界各地，不论是哪个地区的教堂，门窟都呈橄榄形，这是女阴的象征，是女阴崇拜的遗留。这决不是什么淫秽，而是表现它的神圣，因为这是“生命之门”。
